蛋白质组学(Proteomics)以蛋白质组(Proteome)为研究对象,研究一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质,旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式, 其内容包括蛋白质表达与功能分析,蛋白质与蛋白质相互作用分析等。
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。代谢组学是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物进行定性和定量分析的一门学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。
本课程的主要内容包含:了解蛋白质组学研究技术,包括双向电泳、生物质谱技鉴定蛋白质、蛋白质定量与互作,蛋白质组信息学;代谢组学数据处理,代谢组学在肿瘤中的应用。重点是蛋白质组信息学分析技术,难点是了解蛋白质组学实验研究技术。
让学生了解生物信息学产生的历史、现状及发展态势,着重介绍生物信息学基础知识、生物信息学工具的使用、相关算法的开发以及生物信息学在人类重大疾病研究中的重要应用等内容,并掌握通过生物生物信息学方法解决各种生命科学领域问题的能力,以及拥有跨学科综合思考的能力。
(一)考核方式
过程考核(考勤、作业、操作训练)+课终考核(闭卷)
(二)成绩评定办法
成绩构成:课终考核成绩×50% + 过程考核成绩×50%
第五章:蛋白质结构预测与分析(第一部分)
5.1 蛋白质的结构
5.2 蛋白质的二级结构
5.3 蛋白质的三级结构
第五章:蛋白质结构预测与分析(第三部分)
5.8 获取蛋白质四级结构
第二章:生物数据库(第二部分)
2.7 一级蛋白质序列数据库:UniProtKB
2.8 一级蛋白质结构数据库:PDB
2.9 二级蛋白质数据库:Pfam,CATH,SCOP2
第五章:蛋白质结构预测与分析(第二部分)
5.5 计算方法预测三级结构
5.6 三级结构的比对
生物学、生物化学、分子生物学、计算机基础
参考教材:陈铭主编,生物信息学(第三版),科学出版社,2018年6月。
Q: 我是学生物的,计算机基础较弱,能学这门课吗?
A: 会用计算机就能!
Q: 我是学计算机的,生物基础较弱,能学这门课吗?
A: 知道蛋白质、DNA就能!
Q: 我是研究生,学这门课有用吗?
A: 太有用了!