复旦大学药学院“药物设计学”课程建设获得国家级教学成果二等奖，上海市教学成果一等奖、上海市教委重点课程（2011）以及上海市精品课程（2012）。
课程以与药物发现相关的生命科学、化学和生物信息学、理论化学、有机化学和药物化学等学科为基础，围绕药物设计的理论体系、研究策略和方法、实验原理及操作、问题讨论设立25个理论和8个实验知识点，内容包括：导论、药物靶点及其理论、基于结构的药物设计、先导化合物性质设计优化、计算机辅助药物设计实验，实验课包括序列比对、蛋白质结构演示、小分子三维结构构建与优化、小分子药效团模型构建、分子对接，这些将大大帮助广大学生将药物设计学实践性地运用到自己的科研中。

药物设计学是一门不断探索未知的新兴学科，也是适合培养生物医药相关专业学生创新思维和独立性的一门专业课程。药学、化学、生物、医学等相关领域的本科生或研究生适合修读本课程。

1、完成所有课程的学习。
2、期末考试

化学及药学相关的基础知识

《药物设计学》第3版（叶德泳、付伟编写，高等教育出版社，2015）

《计算机辅助药物设计导论》第2版（付伟、叶德泳编写，化学工业出版社，2017） 

《计算机辅助药物设计》（陈凯先、蒋华良编写，上海科学技术出版社，2000） 

《Comprehensive Medicinal Chemistry II》（John B. Taylor 、David J. Triggle编写，Elsevier，2007） 

《药物设计策略》（郭宗儒编写，科学出版社，2012）