微生物高通量数据分析入门_山西医科大学

SPOC学校专有课程

微生物高通量数据分析入门

spContent=微生物是我们看不见的朋友或敌人，而高通量测序是为我们打开绚烂微生物世界的一把钥匙。本课程依托浙江大学农业资源与环境专业教育资源，从原理、技术、实操等多方面，带你逐步了解和掌握微生物高通量测序的原理和方法。

—— 课程团队

课程概述

学习微生物生态不懂高通量测序？——Out了！

高通量测序分析太难不知怎么开始学？——No Worries!

本课程将从零基础开始介绍微生物高通量测序的发展历程、基本原理和常用方法。通过全面的讲解和实例的解析，解决微生物高通量测序是什么、做什么和怎么做的问题。高通量测序技术更新迅速、新方法层出不穷，通过本课程的学习，能够为学员以后的进阶学习夯实基础，达到触类旁通的目的。

授课目标

1、了解微生物高通量测序的发展历程；

2、理解高通量测序的基本原理；

3、掌握常用分析方法的流程和初步的使用。

成绩要求

课程设置“合格”（60分 ≤ 得分<85分），"优秀"（85分≤ 得分）两档结业标准，可根据成绩申请相应证书。

课程大纲

预备知识

R语言、分子生物学、生物信息学。

参考资料

樊龙江.生物信息学.浙江大学出版社, 2017.

李金明.高通量测序.科学出版社, 2018.

Loutit M.W., Miles J.A.R. Microbial Ecology, 2011.

Mayer B.组学数据生物信息学：研究方法与实验方案（导读版）.科学出版社, 2013.

常见问题

Q : 本课程是否需要生物信息学基础？

A : 本课程适合所有对微生物高通量数据分析感兴趣的学员，课程内容难度适中，没有生物信息学基础亦可快速入门。

Q : 本课程是否需要编程基础。

A : 有基础会有帮助，没有基础亦可，课程中将介绍一些常用的分析方法及其具体用法。