SPOC学校专有课程
生物信息学资源检索与利用
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spContent=随着生命科学的飞跃式发展和各种高通量技术的不断出现,生物医学数据呈现爆炸式增长,产生了种类繁多、功能各异的生物信息学数据库和网络分析平台。认识和了解世界各地重要数据资源及相应的分析工具,学习生物信息学数据库的检索方法和技能,提高分析生物信息数据的能力,可以为生命医学研究提供丰富的知识借鉴。 基于此背景,本课程围绕中心法则中基因转录和翻译过程涉及的DNA、RNA和蛋白质,介绍了相关的数据资源以及这些平台提供的在线分析工具,包括三大核酸序列数据库、基因表达数据库、蛋白质结构和功能以及蛋白质组学数据库、药物靶标数据库等。通过本课程的学习,学生可以充分理解生物信息学数据资源和分析方法对生物医学研究的重要性,了解中心法则过程中相关的生物信息学数据资源及在线平台工具,并将学习到的理论知识应用到具体的科研和实际工作中,初步解决面临的生物信息数据的检索和分析问题。
—— 课程团队
课程概述

生物信息学是一门发展潜力巨大的交叉学科。它体现了生物学、计算机科学、数学、物理学等学科间的渗透与融合,通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,达到揭示数据所蕴含的生物学意义从而解读生命活动规律的目的。生物信息学不仅是一门科学学科,更是一种重要的研究开发平台与工具。本课程的主要内容包括生物信息学的概述、生物数据库的查询及搜索、核酸/蛋白质序列的比较分析、分子进化及系统发生、蛋白质结构的预测及分析、基因组学与蛋白质组学、序列算法、统计基础、数据挖掘、编程基础与网页制作。课程打破传统概念型教学方式以实际操作来讲解各种工具软件的使用,通过大量实例的讲解,使理论和实践紧密结合。本课程适用于生命科学、农学、医学、信息科学等相关专业本科生、硕士生、博士生各阶段的同学,以及生物医学领域的科研工作者。【本课程为“2018年国家精品在线开放课程“】

授课目标

让学生了解生物信息学产生的历史、现状及发展态势,着重介绍生物信息学基础知识、生物信息学工具的使用、相关算法的开发以及生物信息学在人类重大疾病研究中的重要应用等内容,并掌握通过生物生物信息学方法解决各种生命科学领域问题的能力,以及拥有跨学科综合思考的能力。

成绩要求

过程考核成绩50%+论文考核成绩×50% 


课程大纲
预备知识

生物学、生物化学、分子生物学、计算机基础

参考资料

参考教材:陈铭主编,生物信息学(第三版),科学出版社,2018年6月。

常见问题

Q: 我是学生物的,计算机基础较弱,能学这门课吗?

A: 会用计算机就能!

Q: 我是学计算机的,生物基础较弱,能学这门课吗?

A: 知道蛋白质、DNA就能!

Q: 我是研究生,学这门课有用吗?

A: 太有用了!