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SPOC学校专有课程
生物大数据
第7次开课
开课时间: 2025年02月25日 ~ 2025年06月29日
学时安排: 4小时每周
当前开课已结束 已有 39 人参加
老师已关闭该学期,无法查看
spContent=“大数据”是时下最火热的词汇,是各行业人士争相追捧的利润焦点。自1977年2月,Sanger与他的同事发表了第一个生物体的完整基因组序列以来,生物学大数据时代也宣告来临。生物学大数据技术的战略意义不在于掌握庞大的数据信息,而在于对这些大数据所蕴含生物学知识的提取。
“大数据”是时下最火热的词汇,是各行业人士争相追捧的利润焦点。自1977年2月,Sanger与他的同事发表了第一个生物体的完整基因组序列以来,生物学大数据时代也宣告来临。生物学大数据技术的战略意义不在于掌握庞大的数据信息,而在于对这些大数据所蕴含生物学知识的提取。
—— 课程团队
课程概述

本课程为线上线下混合教学课程。

线上课程选择了国家精品课程,由省级优秀教师、中科院专家及上市企业技术专家担纲主讲,系统介绍当前生命科学研究及资本追逐的热词—生物大数据,讲授其所蕴含的价值与挖掘利用技术。课程特色之一是内容新颖。本课程是应生物基因组测序技术的发展而创建,面向新一代测序技术所获得的生物大数据,国内外尚无同类课程上线,而一些大型公司更是将其作为高端收费类培训课程。课程特色之二是主讲教师结构合理。由高校教师、中科院研究人员和企业技术人员组成,强强联合、优势互补,使课程内容既具理论高度,又具实用价值。课程特色之三是兼具通识与专业。本课程涵盖通识类知识点和专业类知识点,通识类知识有助于大众学生了解生物大数据的特点、价值与应用,专业类知识帮助学生掌握生物大数据的分析技能。

线下课程由在线开放课程《生物信息技术》的主讲教师进行讲授,通过开展互动式学习活动,帮助学生掌握生物信息学领域的核心内容。

授课目标

1、掌握生物数据的产生原理;

2、能灵活运用所学知识,对生物技术领域案例进行分析讨论。

成绩 要求

为积极响应国家低碳环保政策, 2021年秋季学期开始,中国大学MOOC平台将取消纸质版的认证证书,仅提供电子版的认证证书服务,证书申请方式和流程不变。

 

电子版认证证书支持查询验证,可通过扫描证书上的二维码进行有效性查询,或者访问 https://www.icourse163.org/verify,通过证书编号进行查询。学生可在“个人中心-证书-查看证书”页面自行下载、打印电子版认证证书。

 

完成课程教学内容学习和考核,成绩达到课程考核标准的学生(每门课程的考核标准不同,详见课程内的评分标准),具备申请认证证书资格,可在证书申请开放期间(以申请页面显示的时间为准),完成在线付费申请。

 

认证证书申请注意事项:

1. 根据国家相关法律法规要求,认证证书申请时要求进行实名认证,请保证所提交的实名认证信息真实完整有效。

2. 完成实名认证并支付后,系统将自动生成并发送电子版认证证书。电子版认证证书生成后不支持退费。


课程大纲

第一章 绪论

第一节 大数据的特征与价值

第二节 生物学大数据基本概念

BBC纪录片 人类面对大数据

第一章测验

第二章 核酸数据库

第一节 DNA序列数据库

第二节 NCBI数据库检索策略

第二章测试

第三章 蛋白质数据库

第一节 蛋白质数据库概览

第二节 蛋白质序列数据库

第三节 蛋白质模式和域的数据库

第四节 蛋白质结构数据库

第五节 蛋白质分类数据库

第三章 课件

第三章测试题

第四章 基因组测序技术

第一节 基因组测序技术

第二节 基因组测序方式与质量控制

第三节 基因组测序的组装技术

第四节 转录组测序与分析

第五节 宏基因组测序与分析

第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例

第五章 上机实操

第一节 RNA-Seq数据分析

第二节 基因组重测序数据分析

预备知识

普通生物学、生物化学、基因工程

参考资料
常见问题



Q :  昵称如何设置?

A : 需要根据学校要求设置,一般用学校名称_姓名_学号进行注册,便于统计成绩

Q : 作业能手机作答吗?

A : 务必用电脑作答提交,手机作答可能会导致错误提交失败

Q : 作业一般什么时候发布?

A : 作业在课程视频发布后3小时就会发布

Q : 作业要在多久时间内完成?

A : 作业提交时间(除第一次作业外)截止到下次视频发布时间,也就是下次视频发布前完成,否则影响期末总分;最后一次作业请在期末测试发布时间前完成

Q : 错过了测试和期末时间怎么办?

A : 请关注各个章节的发布时间,错过了就不能再次答题;每个单元测验都有3次机会,取最高分;期末考试只有1次机会,均需登陆电脑进行作答


Q : 视频学习页面打不开怎么办?

A : 有些浏览器可能不兼容,推荐使用chrome浏览器。如有点开学习页面,但显示为空白的情况,请点击鼠标右键,刷新几次,就会出现内容

源课程

该SPOC课程部分内容来自以上源课程,在源基础上老师进一步增加了新的课程内容

四川大学
1 位授课老师
金垚

金垚

副教授

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