天然药物化学（medicinal chemistry of natural products）是系指运用现代科学理论与方法研究药用植物或植物中具有生理活性成分的化学分支学科。

它是随着分离技术和鉴定方法趋于微量、快速而发展的。其研究内容主要是药用植物或植物中活性成分的提取、分离、结构测定，必要的结构改造以及合成，以探索安全高效的新的化合物。

这些研究结果可以对药物的构效关系的探讨提供新的观念和途径，同时对植物成分生源关系和化学植物分类学的研究提供资料。

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