中药材DNA鉴定中,该如何选择DNA序列以确保结果无误

化生1702韩秋燕 发表于2018年06月19日
3 回复

    1楼

  • 只因为爱你 发表于2018年06月21日
    0 | 0 | 举报
    <p>中药材DNA条形码分子鉴定法,指以ITS2为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系,其中植物类中药材选用ITS2为主体序列,psbA-trnH为辅助序列。用已知的有效序列更好。</p>
    只因为爱你 发表于2018年06月21日
    添加评论
  • 2楼

  • spany 发表于2018年06月26日
    0 | 0 | 举报
    <p>中药材DNA条形码分子鉴定通常是以核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)注1为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系,其中植物类中药材选用ITS2/ITS为主体序列,以叶绿体psbA-trnH注2为辅助序列,动物类中药材采用细胞色素C氧化酶亚基i (COI)注3为主体序列,ITS2为辅助序列。[1]</p><p>注:</p><p>1. ITS2:ITS(internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA)为内部转录间隔区,是核糖体RNA(rRNA)基因非转录区的一部分。ITS位于18S rRNA基因和28S rRNA基因之间,中部被5.8S rRNA基因一分为二,即ITS1(thefirst internal transcribed spacer)区和ITS2(the second internal transcribed spacer)区。5.8S、18S和28S进化速率较慢,常用于探讨科级和科级以上等级的系统发育问题。而间隔区ITS(包括ITS1和ITS2)进化速率较快,一般用于研究属间、种间甚至居群间等较低分类等级的系统关系。</p><p>2.psbA-trnH:psbA-trnH基因间区是位于叶绿体基因psbA基因和trnH基因之间的一段非编码区,该间区进化速率较快,常用于植物属间、种间的系统发育研究。</p><p>3.COI:COI为线粒体基因组的蛋白质编码基因,全称为细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ (cytochrome C oxidase subunit I),由于该基因进化速率较快,常用于分析亲缘关系密切的种、亚种及地理种群之间的系统关系。</p><p>DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于不同物种的DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成,因此对某一特定DNA片段序列进行分析即能够区分不同物种。[1]</p><p><br ></p>
    spany 发表于2018年06月26日
    添加评论
  • 3楼

  • 生物2011 刘晓婷 10 发表于2022年04月01日
    0 | 0 | 举报
    中药材DNA条形码分子鉴定通常是以核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)注1为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系,其中植物类中药材选用ITS2/ITS为主体序列,以叶绿体psbA-trnH注2为辅助序列,动物类中药材采用细胞色素C氧化酶亚基i (COI)注3为主体序列,ITS2为辅助序列。[1] 注: 1. ITS2:ITS(internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA)为内部转录间隔区,是核糖体RNA(rRNA)基因非转录区的一部分。ITS位于18S rRNA基因和28S rRNA基因之间,中部被5.8S rRNA基因一分为二,即ITS1(thefirst internal transcribed spacer)区和ITS2(the second internal transcribed spacer)区。5.8S、18S和28S进化速率较慢,常用于探讨科级和科级以上等级的系统发育问题。而间隔区ITS(包括ITS1和ITS2)进化速率较快,一般用于研究属间、种间甚至居群间等较低分类等级的系统关系。 2.psbA-trnH:psbA-trnH基因间区是位于叶绿体基因psbA基因和trnH基因之间的一段非编码区,该间区进化速率较快,常用于植物属间、种间的系统发育研究。 3.COI:COI为线粒体基因组的蛋白质编码基因,全称为细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ (cytochrome C oxidase subunit I),由于该基因进化速率较快,常用于分析亲缘关系密切的种、亚种及地理种群之间的系统关系。 DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于不同物种的DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成,因此对某一特定DNA片段序列进行分析即能够区分不同物种。[1]
    生物2011 刘晓婷 10 发表于2022年04月01日
    添加评论