畜牧微生物学是动物科学专业一门重要的专业必修课，对动物科学领域的研究至关重要。畜牧微生物学是微生物学的农业应用领域的一个分支，是在普通微生物学、农业微生物学、食品微生物学、乳品微生物学、兽医微生物学等基础上发展而成，它综合并应用各种微生物学的理论和知识，解决饲料原料收割、贮藏、加工调制，畜禽养殖，畜产品加工、检验、贮藏，畜禽废弃物处理等方面有关的微生物学问题。以期通过微生物学技术在畜牧全产业链中的应用，为绿色、安全、高效的畜禽养殖提高支撑。

该课程设置了绪论、饲料微生物毒素防控、微生物饲料研发、消化道微生物利用、畜产品相关的微生物和畜禽粪污资源化利用，六章内容。针对微生物毒素类别、常见的霉菌毒素、饲料中霉菌毒素的限量标准、饲料常见霉菌毒素污染情况、日粮黄曲霉毒素的生物转化、霉菌毒素的预防与清除、霉菌毒素的生物脱毒技术、微生物饲料的定义和分类、发展微生物饲料的必要性及其加工工艺、微生物发酵饲料加工工艺的优化、青贮原理及原料类型、青贮饲料中的微生物、青贮的发酵过程、青贮饲料的加工与调制、青贮饲料品质评定、益生菌的作用机制、益生菌的安全风险、益生菌的筛选与安全性评价、益生菌的益生特性评价、全基因组序列分析在益生菌开发中的应用、益生菌的靶向递送、提高益生菌定植概率和作用的路径、消化道微生物多样性与宿主协同进化、消化道群落常用术语、微生物群落分析技术、微生物群落的α多样性、微生物群落的β多样性、微生物群落间差异分析、微生物功能分析、利用共生微生物实现动物的健康和高效生产、畜产品相关的微生物和畜禽粪污资源化利用进行了详细的讲解。

通过视频、作业、学习指导、在线测试等多种教学内容，使学生掌握畜牧微生物学基础知识、了解畜牧产业痛点和解决路径，提升微生物学相关文献阅读和理解能力。