福建农林大学

生物大数据

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课程概述

生物大数据所蕴含的巨大潜在价值使其备受关注。本课程起于大数据,讲授生物大数据的产生、分析与应用。课程特色之一是课程本身及课程内容新颖。本课程是应生物基因组测序技术的普及而创建,讲授的内容面向新一代测序技术所获得的生物大数据。目前国内外尚无同类课程上线,而一些大型生物公司将其作为高端培训课程。特色之二是教学师资结构合理。本课程教学团队由高校教师、中科院研究人员和企业技术人员组成,强强联合、优势互补,使课程内容既具理论高度,又具实用价值。特色之三是兼具通识与专业。本课程涵盖通识类知识点和专业类知识点。可根据对象不同,选择不同单元组合进行学习。通识类知识有助于大众学生了解生物大数据的特点、价值与应用,专业类知识帮助生物类或计算机科学类专业学生掌握生物大数据的分析技能。



证书要求

1. 完成所有课程的学习

2. 完成课程视频中的测试题(30分)

3. 完成4次主观题作业(30分)

4. 参加课程考试,并完成考试内容(40分)

总分超过60分可获得合格证书。


5. 优秀学员要求:

5.1 总分超过85分可以获得优秀学员。

5.2 其他对课程有特殊贡献的学员,可以获得10分加分;包括推广课程、积极帮助其他学员,以及积极帮忙改进课程的学员。

预备知识

普通生物学、分子生物学、生物化学

授课大纲

“生物大数据”精品在线课程大纲

(32学时、2.0学分)

第一章:绪论

  1. 大数据的特征与价值

  2. 生物学大数据时代特征

  3. 生物信息学的发展与应用

第二章:生物学数据库及其搜索

1. 核酸数据库及其在线搜索

2. 蛋白质数据库及其在线搜索

3. 序列比对工具BLAST

第三章:生物大数据分析

1. 基因组测序技术原理

2. 基因组测序方式与质量控制

3. 基因组de novo 组装与注释

4. 基因组Reference 组装与分析

5. 转录组测序与分析

6. 生物学大数据在农业上的应用

7. 生物学大数据在医学上的应用

第四章:其他

1. R语言在生物信息学上的应用

2. PERL在生物信息学上的应用

3. 统计学在生物信息学上的应用